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目前提供的基于飞腾的Linux系统共有两种, 一种基于debian系统, 采用debian自带的apt/dpkg作为包管理系统, 另一种则是基于ipk的专用系统.

基于ipk的系统升级方式如下:

<syntaxhighlight lang="bash" line>
# 使用ssh或者串口登录飞腾系统
echo "src netone http://ipk.gxwatek.com" > /root/ipkg.conf
ipkg-cl -f /root/ipkg.conf update
ipkg-cl -f /root/ipkg.conf upgrade
</syntaxhighlight>